Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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