Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
D130040H23RikQ8BII3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms