Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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