Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms