Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M10.5Q85ZW7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms