Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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NfascQ810U3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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NfascQ810U3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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NfascQ810U3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NfascQ810U3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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NfascQ810U3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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NfascQ810U3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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NfascQ810U3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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NfascQ810U3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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NfascQ810U3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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NfascQ810U3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfascQ810U3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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NfascQ810U3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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