Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms