Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Smim19Q80ZU4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Smim19Q80ZU4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Smim19Q80ZU4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Smim19Q80ZU4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Smim19Q80ZU4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Smim19Q80ZU4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Smim19Q80ZU4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Smim19Q80ZU4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Smim19Q80ZU4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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