Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap100Q80VN0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms