Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ttc29Q80VM3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ttc29Q80VM3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ttc29Q80VM3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ttc29Q80VM3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ttc29Q80VM3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ttc29Q80VM3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ttc29Q80VM3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Ttc29Q80VM3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ttc29Q80VM3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ttc29Q80VM3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms