Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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