Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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