Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ScocQ78YZ6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ScocQ78YZ6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ScocQ78YZ6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms