Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms