Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms