Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms