Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms