Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms