Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms