Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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