Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trak1Q6PD31 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trak1Q6PD31 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms