Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms