Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smchd1Q6P5D8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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