Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms