Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms