Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nop58Q6DFW4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms