Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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