Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf280dQ68FE8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Znf280dQ68FE8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Znf280dQ68FE8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Znf280dQ68FE8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Znf280dQ68FE8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf280dQ68FE8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms