Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms