Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms