Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms