Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctr9Q62018 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms