Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms