Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tfap2bQ61313 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms