Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln3Q61124 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms