Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms