Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PtprnQ60673 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PtprnQ60673 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PtprnQ60673 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprnQ60673 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PtprnQ60673 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprnQ60673 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprnQ60673 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprnQ60673 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprnQ60673 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprnQ60673 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprnQ60673 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprnQ60673 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprnQ60673 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms