Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms