Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms