Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Syne3Q4FZC9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Syne3Q4FZC9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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