Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shank3Q4ACU6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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