Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc110Q3V125 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc110Q3V125 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc110Q3V125 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc110Q3V125 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc110Q3V125 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc110Q3V125 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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