Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms