Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms