Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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