Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Usp19Q3UJD6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp19Q3UJD6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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