Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms