Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms