Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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Gtpbp6Q3U6U5 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Gtpbp6Q3U6U5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Gtpbp6Q3U6U5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Gtpbp6Q3U6U5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Gtpbp6Q3U6U5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms