Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms